TBseek - Pengujian Gen Mycobacteria dan Resistensi Obat

TBseek - Pengujian Gen Mycobacteria dan Resistensi Obat

① Latar belakang

1.jpg

Berdasarkan statistik tuberiosis dari Organisasi Kesehatan Dunia (WHO), pada tahun 2022, 30 negara dengan beban kasus tertinggi menyumbang 87% dari kasus tuberiosis baru. Delapan negara, yaitu Bangladesh, China, Republik Demokratis Kongo, India, Indonesia, Nigeria, Pakistan, dan Filiphina menyumbang 2/3 dari total tersebut. Tuberculosis multiresistensi (TbMR) masih menjadi kebuntuan kesehatan masyarakat dan ancaman keselamatan kesehatan. Pada tahun 2022, hanya sekitar 2/5 kasus TbMR yang menerima perawatan. Dalam beberapa kasus, jika perawatan tidak tepat, bisa muncul bentuk TbMR yang lebih serius. Pre-XDR-TB dan XDR-TB adalah jenis tuberiosis yang memiliki respons yang lebih sedikit terhadap obat yang tersedia. Metode diagnosis mikrobiologi tradisional adalah standar emas dalam deteksi Mykobacterium tuberculosis kompleks (MTB). Namun, metode-metode tersebut memiliki tingkat false negative/positive yang tinggi, sensitivitas dan spesificitas yang rendah, tidak dapat membedakan MTB dan non-MTB, serta waktu diagnosis yang lama. Diagnosis infeksi menular tradisional merupakan diagnosis yang menantang dan sangat dibutuhkan metode deteksi agen penyebab dan resistensi yang cepat, komprehensif, dan akurat.


 Teknologi

Berdasarkan platform sequensing pola nanokelvin (nanopore) dan teknik PCR super multi, sebuah proyek yang dikembangkan secara mandiri telah dibangun untuk deteksi target kompleks Mycobacterium tuberculosis dan mykobakterium tidak tuberkul. Ini dapat mendeteksi secara bersamaan kompleks Mycobacterium tuberculosis, 40 spesies mykobakterium tidak tuberkul ( termasuk 17 spesies yang paling sering ditemui di klinis), 6 gen resisten terkait 4 obat tuberkul klinis pertama, dan 13 gen resisten terkait 11 obat tuberkul klinis kedua.

6390217012010636344822482.jpg

 

 Lingkup Pemantauan

A. Kompleks Mykobakterium Tuberculosis (MTBC), termasuk Mykobakterium Tuberculosis, Mykobakterium Tuberculosis Afrika, Mykobakterium Tuberculosis Kambing,dsb.

B. 40 spesies Mycobacterium nontuberculin, dengan fokus pada 17 spesies yang paling sering ditemukan dalam lingkungan klinis.

C. 6 gen resisten terkait dengan 4 obat tuberkulasi first line. 13 gen resisten terkait dengan 11 obat tuberkulasi second line.

Kompleks Mycobacterium tuberculosis (MTBC)

Mikobakterium tuberkulosis

Mycobacterium bovis

Mycobacterium africanum

Mycobacterium canettii

Mycobacterium caprae

Mycobacterium microti

Mycobacterium pinnipedii

Mycobacterium mungi

Mycobacterium orygis


Non-tuberculous mycobacteria (NTM)

Mycobacterium avium complex (MAC)

Mycobacterium kansasii

Mycobacterium abscessus

Mycobacterium fortuitum

Mycobacterium chelonae

Mycobacterium marinum

Mycobacterium xenopi

Mycobacterium gordonae

Mycobacterium szulgai

Mycobacterium haemophilum

Mycobacterium scrofulaceum

Mycobacterium malmoense

Mycobacterium simiae

Mycobacterium goodii

Mycobacterium mucogenicum

Mycobacterium genavense

Mycobacterium peregrinum

Mycobacterium terrae

Mycobacterium triplex

Mycobacterium wolinskyi

Tabel di atas hanya menampilkan sebagian dari area pemeriksaan

 

④ Orang yang cocok