①　Latar Belakang Proyek

Thalassemia adalah penyakit hemolisis kronis genetik yang disebabkan oleh kekurangan atau mutasi genik yang inheren menyebabkan hambatan atau penurunan kecepatan sintesis rantai globin hemoglobin, sehingga produksi hemoglobin menurun. Thalassemia juga dikenal sebagai hemoglobinopathy dengan penyimpangan sintesis globin. Thalassemia adalah salah satu penyakit genetik monoslekton dengan tingkat kejadian tertinggi dan paling mempengaruhi di seluruh provinsi di bawah sungai Changjiang saat ini, dan juga penyakit defek kelahiran lokal yang serius mempengaruhi kesehatan anak-anak dan populasi kelahiran serta memberikan beban yang berat secara emosional dan ekonomi pada keluarga dan masyarakat.

        Hiperplasia adrenal kongenital (CAH) adalah sekelompok kelainan genetik autosomal resesif yang disebabkan oleh defek pada berbagai enzim katalitik pada berbagai tahap jalur sintesis steroid korteks adrenal, yang terutama mengakibatkan gangguan sintesis kortikosteroid. Tingkat keparahan dan gambaran klinis CAH bergantung pada aktivitas residual enzim-enzim ini, dan dalam kasus yang parah, dapat mengancam jiwa. Pasien CAH tipikal dan atipikal juga menunjukkan berbagai fenotipe klinis, termasuk insufisiensi adrenal, genitalia yang tidak jelas atau gangguan perkembangan seksual, infertilitas, perawakan pendek, dan peningkatan risiko sindrom metabolik pada masa remaja dan dewasa.

Sindrom Fragile X (FXS) adalah kelainan gen tunggal yang paling umum menyebabkan disabilitas intelektual bawaan dan gangguan spektrum autisme (ASD), kedua setelah sindrom Down dalam hal insidensi. Lebih dari 99% kasus disebabkan oleh messenger fragile X pada kromosom X, yang menyebabkan duplikasi CGG dan metilasi abnormal gen ribonukleoprotein 1 (FMR1), sehingga mengakibatkan penghapusan protein FMRP yang dikodekannya. Sisanya disebabkan oleh mutasi titik atau mutasi penghapusan pada FMR1, yang menunjukkan pewarisan dominan tidak lengkap terkait X.

Atrofi otot tulang belakang (SMA) adalah penyakit neuromuskular herediter yang disebabkan oleh degenerasi neuron motorik tulang belakang, yang menyebabkan atrofi otot rangka dan otot secara umum. Ini adalah salah satu kelainan genetik resesif autosomal fatal yang paling umum pada bayi dan anak kecil. Penyakit ini terutama disebabkan oleh mutasi pada gen patogenik, survival motor neuron 1 (SMN1). Individu normal memiliki dua salinan SMN1. SMA didiagnosis ketika ada delesi homozigot dari kubah ke-7 gen SMN1 atau mutasi heterozigot majemuk pada SMN1. Gen patogenik SMN1 dan gen pengubah SMN2 sangat homolog, mengekspresikan sekitar 10% dari protein SMN lengkap dengan fungsi normal. Gen SMN2 memiliki peran kompensasi dalam delesi gen SMN1.

②　Pengenalan Proyek

Sequencing Nanopore memiliki keunggulan teknologi yang komprehensif seperti memiliki read panjang, tidak memihak GC, serta mampu menseqencing secara akurat pada area yang kompleks seperti area yang sangat berulang. Dengan menggunakan metode capture dengan probe dan metode amplifikasi panjang multi, capture dan sequencing pada gene dan area yang berpotensi penyebab penyakit dapat dilakukan, yang dikombinasikan dengan platform NANOPORE generasi ketiga yang mampu melakukan sequencing single molecule secara real time, secara benar dapat mewujudkan capture dan sequencing gene yang terkait dengan penyakit monogenic kompleks.

Sebaliknya, metode tradisional memiliki banyak kekurangan. Misalnya, dalam pengujian talasemia, PCR konvensional hanya dapat mencakup 23 situs, sehingga membatasi jangkauan deteksi; dan sekuensing generasi berikutnya memiliki panjang bacaan yang pendek, sehingga membatasi kemampuannya untuk mendeteksi triplet yang disebabkan oleh rekombinasi homolog, tipe Hong Kong, dan delesi fragmen besar; dalam pengujian hiperplasia adrenal kongenital, metode tradisional hanya dapat mendeteksi CYP21A2 dan tidak dapat membedakan jenis CAH lainnya, sehingga membutuhkan keahlian klinis yang tinggi; dan ada kemungkinan hasil negatif palsu dalam mendeteksi duplikasi dan delesi jumlah salinan gen.

③　Luas cakupan pengujian

④ Keunggulan Proyek

Jangkauan pemeriksaan yang luas: Pemantauan gen sasaran secara keseluruhan dalam satu kali, dan mampu menemukan variasi struktur baru atau jenis mutasi titik;

Pemilahan genetik presisi: Mampu melakukan identifikasi gen homologus secara presisi, tidak membutuhkan keluarga, mendapatkan varian genik konstan/ terbalik secara langsung, mendapatkan susunan yang presisi;

Sensitivitas tinggi: dapat mendeteksi berbagai jenis mutasi dan insersi “AGG”.

⑤　Orang yang berhak

Pemeriksaan carrier pada kelompok populasi sebelum pernikahan, sebelum hamil dan sebelum melahirkan untuk mengukur risiko kehamilan, diagnosis preskriftif pada fœtus berisiko tinggi untuk mengurangi kejadian defek kelahiran yang serius  

Melalui pemeriksaan kromosom paling umum, pasangan yang berencana untuk hamil anak ke tiga melalui IVF dan berisiko tinggi dapat diperiksa untuk PGT-M untuk mengandung penyakit monogenic yang umum, agar dapat melahirkan anak yang sehat.

Pemeriksaan genetik monogenic yang umum terhadap bayi baru lahir, deteksi dini intervensi dini pengobatan dini, mengurangi kematian dan disabilitas pada anak dengan penyakit genetik, meningkatkan kualitas hidup.

Penggolakan genetik pasien atau diagnosis differentiasi pasien yang diduga